影片為《哥斯拉 怪獸行星》續作。人類要從哥斯拉手中奪回地球的戰鬥仍在繼續。而打敗哥斯拉的關鍵卻是某神秘機械武器，而該武器早在兩萬年前就已經丟失。

本作講述小智和皮卡丘來到叢林與一名神秘少年相遇後發生的故事。

場版內容是電視動畫的總集篇，前篇標題是《來自深淵 啟程的黎明》，後篇標題是《來自深淵 流浪的黃昏》，兩部會在2018年冬天上映。另外，還有新作故事動畫正在製作。 本作為TV版總集篇：總集篇(上) 啟程的黎明總集篇(下) 流浪的黃昏

利姆路・坦派斯特為拯救夥伴而進化成為了魔王。在位於他與夥伴們共同建立的魔物之國「魔國聯邦(坦派斯特)」西方的「拉賈小亞國」，有著持有不可思議力量的女王，長久以來圍繞著這個國家的陰謀將掀起漣漪。然而，「食人魔的倖存者」緋色突然出現在利姆路等人面前。利姆路的同伴紅丸等人與這個對他們來說有如大哥般的存在重逢。這段過去一度斷絕的「紅蓮之絆」，如今將成為引發新戰鬥的導火線…！？

第 03 話 恩仇的彼方____

女高中生織部睦美等人在休學旅行中遭遇空難，漂到了一座孤島上，而這座島上，居然有著各種巨大的昆蟲！還只是一群高中生的他們，能從這座地獄般的島上逃出生天嗎？