以少女「小馬座翔」作為主角，身為雅典娜的侍女的聖鬥少女們將為了保護她，並為了粉碎邪惡女神的野心展開戰鬥。故事開始的時間點是在原作的「銀河戰爭」期間，因此本傳中的星矢等人也會登場。

統括診斷部是天醫會綜合醫院所設立的特別部門，這裡聚集了被各個醫生判定為「難以診斷」的患者們，甚至還有連警察都束手無策、原因不明的「殺人事件」及「謎團」。堅持自己撞見河童的少年；因為看到鬼火而害怕不已的護理師；人工流產後，發現孩子竟重回體內的女高中生。在這些看似不可思議的「事件」背後，其實隱藏著意想不到的「疾病」？「這謎之病狀，就讓我來下診斷吧！！」身為副院長兼診斷部部長「天久鷹央」，將會揭曉隱藏在各種光怪陸離疾病之下的驚人真相！由思路清晰、博學多聞的天才女醫師來解開所有謎團——新型態醫學推理故事登場！

高中一年級的冬天，丸末晴在橋上偶遇班上的美少女作家可知白草，自此就喜歡上她。白草平常貫徹冰山美人的形象，對旁人態度十分冷淡，只對末晴相當友善。當末晴鼓起勇氣準備表白之際，卻意外得知白草已經有男朋友，備受打擊。之前曾向末晴表白但遭拒絕的青梅竹馬志田黑羽在此時從旁教唆：「與其這麼痛苦，不如報復吧？來給她一場最棒的復仇吧！」末晴惱羞成怒，同意了黑羽的說法。目標是可知白草、以「戀愛報復戀愛」的「初戀復仇」自此展開，並將全校捲進一場大騷亂之中。

從奈落（底層）爬起來！一切都是為了改變這個「糞土般的世界」——！路德居住在天界的貧民窟中，天界的富人經常將他們製造的垃圾扔到邊緣和深淵，而窮人在富人奢侈生活的陰影下艱難度日。有一天他被誣陷犯了謀殺罪，這個冤枉的判決使他受到了難以想像的刑罰——與其他垃圾一起被丟棄到奈落。在地表上，人類的廢棄物滋生了兇惡的怪物，如果路德想知道真相並對天界復仇，他必須掌握新的力量，並加入一個被稱為「清道夫」的團體，與深淵中的巨大斑獸作戰！

少女宮下藤花，當她察覺到世界之敵的時候便會誕生出另一個名為不吉波普的人格。圍繞著各種奇怪的事件，少年與少女們的故事慢慢展開了。

这里没有魔法，没有斗气，没有武术，却有武魂。唐门创立万年之后的斗罗大陆上，唐门式微。一代天骄横空出世，新一代史莱克七怪能否重振唐门，谱写一曲绝世唐门之歌？百万年魂兽，手握日月摘星辰的死灵圣法神，导致唐门衰落的全新魂导器体系。一切的神奇都将一一展现。唐门暗器能否重振雄风，唐门能否重现辉煌？