2007年的東京，遠野貴樹在從事系統工程師的工作，過著忙碌的日子。出來社會工作後，季節和季節、年和年之間的區分變得曖昧起來，不知不覺就過了數年。那年年尾，貴樹和交往了3年的水野理紗分手了。 2008年，貴樹在春天來臨前辭職了。他既覺得有無數的理由要他這樣做，同時又覺得能令自己接受的理由其實一個也沒有。不久空氣慢慢變得暖和，櫻花的季節也到訪東京。在一個恬靜的平日，中午過後，貴樹披上薄外套，走在街上。經過鐵道時，與迎面而來的女子擦肩而過的瞬間，猛然想起了多年未見的明里。在通過鐵道緩緩轉過身，兩人目光交錯，就在心與記憶即將沸騰的瞬間，卻被疾馳而過的小田急線列車擋住了視線。而在電車通過時貴樹就已在心中下了決定，待電車通過後發現女子早已離去時微微一笑轉過身去。 劇場版: BTSync

知道天空有多藍的人啊/見過湛藍天空的人啊 居住於被山環繞的小鎮，17 歲的高二生相生葵無意於備考，只顧著彈奏最喜歡的貝斯，沉浸在音樂的世界中，讓姊姊茜擔心不已。姊妹倆在 13 年前失去了父母，當時高三的茜原本打算與戀人一起到東京發展，卻因為這起事件放棄上京，放棄戀愛、青春，毅然決定扶養妹妹長大。某天鎮上舉辦音樂祭，出現在演出名單上的「金室慎之介」，是姊姊茜以前的戀人，也是教會葵音樂美好之處的人。此時，「他」突然出現了。「他」是從過去穿越而來的 18 歲的慎之。從沒想過會再與高中生姿態的慎之介再相會，葵漸漸愛上了他……連結過去與未來，四人之間揪心的四角關係，「第二次的初戀」即將展開。

路人女主的養成方法 Fine 某個春天的日子，安藝倫也決定做一部以在櫻花飛舞的坡道上命中註定般相遇的少女——加藤惠為女主角的同人遊戲。邀請了加入了美術部、作為同人插畫家活動的澤村·斯潘塞·英梨梨，以及學年第一的優等生、作為輕小說作家活躍的霞之丘詩羽，成立了blessing software。終於發表了第一部作品。 英梨梨和詩羽為了開發遊戲大作《Fields Chronicle》，來到了人氣創作者紅坂朱音的身邊。 blessing software的代表倫也繼續進行社團活動，與副代表惠一起開始了新作的開發。啟用學妹波島出海為插畫師，委託出海的哥哥——伊織為製作人，和冰堂美智留以及她的樂隊——icy tail一起進行新作的開發…… 英梨梨和詩羽的大作究竟如何？倫也和惠的關係有什麼異變？ blessing software究竟將去向何方？圍繞路人女主的青春塗鴉，迎來大結局。

突然襲向全世界的一個前所未有的大災難“第二次沖擊”。這災害令接近半數人類死亡，世界各地亦留下了大破壞的痕跡。正當人們以為終於回復和平日子的時候──14歲的少年碇真嗣被父親召來第三新東京市。當他正等待迎接時，眼前的山間突然出現一隻巨型生物！這是被稱為“使徒”的神秘存在，它正與國連軍展開激烈交戰。受到爆風波及，陷入危機的真嗣。把他救出的是一位名為葛城美里的女性。乘坐美里的車來到特務機關NERV總部，真嗣和他父親相隔十年終於再見。然而，真嗣卻被父親碇源堂帶往參觀秘密開發的巨大人型兵器，更被迫與使徒對抗。這就是真嗣與人造人EVA初號機的相遇。雖然真嗣採取反抗態度，但當他看到女性駕駛員綾波麗的傷勢後，終於否定了逃避念頭，決意出擊。在未受任何訓練之下，首次與使徒對峙的EVA初號機和真嗣。被託付了全世界命運的14歲少年真嗣，到底會怎樣戰鬥？還有隱藏在第二次沖擊背後的“人類補完計劃”的真相又是什麼？ 掌握著所有謎團的碇源堂，只是靜靜地註視著苦戰的真嗣……

在參拜母親墳墓的回程途中，真嗣和葛城美里遭遇了第七使徒的攻擊，關鍵時刻2號機勢如破竹挫敗對手，真嗣也由此結識了2號機的操縱者式波·明日香·蘭格蕾，與沈默寡言的綾波麗不同，明日香自信張揚，甚至有些自大，在和真嗣相處的日子裡，彼此鬧出不少的笑話，他們三人分別駕駛著零號機、初號機和2號機，抵抗了第八使徒猛烈的攻擊，在這一過程中，淡淡的情愫悄然在這三個青年男女的心中萌生，不久後，第九、十使徒相繼降臨，真嗣他們面臨著生與死的殘酷考驗。

在京都居住的內向男高中生直實（北村匠海 配音）的面前，突然出現從10年後穿越而來26歲的自己（松坂桃李 配音）。未來的直實告訴他，自己不久便會與琉璃（濱邊美波 配音）相愛，可是之後煙花大會時她卻會因為一場事故意外離世。為了拯救愛人，16歲的直實捲入了這場現實與虛擬的記憶世界，經歷了一系列超乎想像的事情。即使世界毀滅，我也想再見你一面。 劇場版: BTSync